Transcript: LINC01247:1

Basic information

LNCipedia transcript ID: LINC01247:1 
HGNC Gene Symbol: LINC01247    
HGNC Full Gene Name: long intergenic non-protein coding RNA 1247
Ensembl Gene ID: ENSG00000227007
Ensembl Transcript ID: ENST00000448901
RefSeq ID: NR_110251
Location (hg38): chr2:6366010-6375422
Strand: -
Class: intergenic
Sequence Ontology term: lincRNA
Transcript size: 4209 bp
Exons: 3
Sources: Broad Institute; Ensembl release 64 - Sep 2011; Gencode v13; Ensembl release 68 - Jul 2012; NONCODE v4; Ensembl release 75 - Feb 2014; Refseq - Dec 2014; Ensembl release 83 - Dec 2015; Ensembl release 87 - Dec 2016; Ensembl release 90 - Aug 2017; Ensembl release 92 - Apr 2018; Refseq - NCBI Annotation Release 106
Alternative transcript names: TCONS_00003175; ENST00000448901; ENST00000448901.1; AC105253.1-001; OTTHUMT00000322744.1; NONHSAT068840; NR_110251; NR_110251.1
Alternative gene names: XLOC_001962; linc-RNASEH1-8; ENSG00000227007; AC105253.1; ENSG00000227007.1; OTTHUMG00000151457.1; LINC01247;

RNA sequence:
AGTATTCTGTAAGGACATTTGTGTTTATATATATCTGTCATATGTATATATATATCATATATATATCAGTCATATATATATCTCACACATATATGTAAGTGATTTTATGCTATGTATCTTTTTTTCTTCTGATATCTTTTTCTGGTTTCAATGTTAGTTTAATGCTAGCTTCATCAAATAAGTTGGGAAGTGGTCTTTTACTCATATTTTGAAAGAATTTGTGTAGAATTACTATAAATTGTTAAGGAGAATTTTTGTAGAATTTGCTAGTGAATATATTTATGTTTTGAATTTTCTTTTGTGGAAGGTTTTTACTACAAATTCCACTTACTTAGTAGAATTAAGATTATTCAAGTTATCTAATTTTTTACTGAGTAATTCTGGTCTCATTATGTCTTTCAAGGGAATTTTTTTCATTTTTTAATATCATTTTATAGCTTTATATTAAAAGTTCTGAATATGAGTGGCTCTCTGCCTGCTCCCTTTCACCACCTTAATATCTTAAGTGAATAATGCATTCTCATCAAGAGGGTTAAAACTAATCATCAGCTGATGGCAGTTCACTTTTTGAATTACAAAAAACTTTCCCCCTCAGGCCATTTATTTTACTCATAAGCAACCTAACTATATTATAGATTCTAAAATATTATCTCCAAAGCCCCTAGAAGATGCATACATTTAGTCCAAAAGGTTTAATAACTCCCCAAGCTGATATTTCCCTTTCTCCTTTGATATTTCCATAATTTGGAGTGCCCATTGTCTGTTTTATTTCATATTGGGACAAGCTGAACAGGGACTAAGGTGAAGGCAGAGAGGCATTCAGGGCAAATCGTTTAAGGAGGTACTACAAATACAAGGTCAACACTTGCAGGAAACTAAGAAAGAGTGTCTCCTTAAAATTTGTGTCCTAGGTGTCTTATCTAGTTCTGGCCTTTTTAATGTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGAAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCACTGGTGCGATCTCGCCTGACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGGGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTGAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATCAACCACTGCACCCAGCTTGAATTCTTTGTGTCCTCTAAAAACTCAAAATTATTTTTTAGTATTTTACCAGAAACATGGGAGGCATCAATTTAAAAGGAATGCACAGAAGACACTTCATCACTACTTCCAACCAAGCAGTAATGGGCTGGAGATCCTAGATTAAGCTACTGGCAGATCTGGTGTCTGGCGAGGGCTCTGCTCCTGGTTTGCAGATGGGTGTCCTCTCATTATGCCCTCGCATGGTTGAGAGAAAAATCATCGTTCTTCTGTTTCTTCTTAGAAGGGCACTAATTTTATTCATGAGCTCCATCCTCATGACCTAATCACAGCCTAAAGGCCTCACCTCCTAATACTATTATATTGGGGGTTTAGATTGCAACGTATGTATTTGGGGGGGTCGGCACAAACATTCAGCTCATAACATCTTGTGAATCACTTTTAATTGCAATGTTGGAACATTGCTTTAAAATGATGCAGGTCTTATTTCCATATATGCATTAGGCAGTTCTTGCATTGCTATAAAGAAATACAGGAAACTGGGTAATTTATAAATAAAAGAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCTGTAGGCTTTACAGGAAGCATGGTGGTGCTCAGATCTGCTTGGCATCTAGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCATTCATGGCAGAAGGTGAAGACAGAGTAGGTATGTCGTGTAGTAAAAGCAGGAATACGCAAGAGACAGAGTGGGGGGCGGTGCCAAACACTTTTAAATGACCACATCTCATATGAATTCAGGGCAAGAGCTCACTTAATCACCAAGGGGTTGGCCCAAACCATTCATGAGGGATCTGCCCCCATTATCCAAATCCCTCTGCCAGTCTCCAACATTAGGAGTTACACTTCAACACGAGATTTGAGTGGGGACAAATATCCAAACTATATTAAGAAGAAACGCAGCAGTTCCCAATTTTGTCTCTCATCACCCTCCCACACACCAAATCATATATGTGAGGAGTACTTTTATATGCACAACTTGCCCTATTTAGAACTGTTCTGGAATGAGTGCATTTCCCATAGTACTATCTAAAATTCCATCCCCTGCAGTTCCCTTCAAGAAACCACATGACAGTATCAATAATGCATTGCATTTTAGGAATAAAGTTAAATATTTTCTAATTTATTTTAACCATTAATAAACTGTTCTTAACTCTTTTTATAACAATAATTTTTAGATCAGTTCACAAGTGATTACAACACACACGGCAGCAAGATGGATAATTGCTGTCCTAATGCATACATTACACTAAACATTATTACATACAATGATATTGCCAAGGATTTAAAATTTTGATCAGCAGTTTCAGGAAGCTAGGAGCTTTTAACTAAATGGATGAATCATGGAGAAGAGTCCCGCCATTTCTCGTTCAAGATTGGTGACTCAGTGTCAGTGGGACATGAGACTTCTATGATCTGACCTTAGAATGACCCCTTTTTATGGTGGAACAAGGTTTTAAGCAAGGCCATTCCCCTGGAGCCATAAAGGATTGACTAGGGAAGATTGCACTGAGCTTTGCTATGAACAGGGCTGCTGCATTTTTGTGATTTTTCCCCAGTCTGTGGTTTTTCCTGAGCCTGTATCCAGACAGTGGTCATTCCAAGTCCAGCTTTGCTGTCTGTTACAGCTTCTGTTTGACTATGTCTTTATACTCTTGCCTTATTAAGTTATAAAACTGTTTATTGCTTTATTGTCTCAGCTCAAAGGTGAATAACAAAACCCCAAGCATATGTCAGCCTTGGAAATTTAGTATTGACCTTCCTGGGCCCTCAGTGCCTGCTCATTTCCTATACCTAGCATTTACGTTTCCAATGCTTCATCTACACCTTCATTCACTACTACCTATATGTCATTTGCCTTATTATCTATGGTACGTATACTGAGTTCTAGTAAAATAGTATTTCAAGTGCAAGTTTACACATTCCTTATATTAACTTTAATTCAATACTTGCCATTTCTTTTTTGCTTCAGAACCAGGAGTTGAAAATATTTCCATTTGTCTTTTAAAGAGGTTATAAAATTGTCACAAGGACATGGGACATGCTGGCTATTTTTCCCTTTTTACTATTTTATAGCATCCAATTAGGTGGATAATAAAATTCTTATTTTTCCAATGAGTAGTCCAAGACTTCACGAATAAAAGTACCATGCTTAATGTCACACTACTAACAAGCGGCAGGACCAGTGTTTAAATGTAAATATATCTTATTTCAAAATTTGTTTGTTTTACCAAATTTTGTAGCTCCTTCCAAGACTCCCAACCTTCACCTTTTCTTTCTATCCCTAAGAATACATATGATTTTCACATACGAAGTTCGTTTATAACCTTTTGCTAATTAATTAGTGAAAAAAGATGCAATGAATTTTGCAAAATGTCATGCAAAAAATGAAGCAGGAACAGACAATTAGGAAATATTAAACCATGGTTAGTAGCATTGCATATCAGCATTGGTTTGATTGTAATTTCATTGTTCTGGACTCTCGCTTGTTTAGTTGGTGTCCCTGAGGCCTGCAGTCCTTCCAGGTGCTGAGAGTGGAGCTTCCCAGGCCTTCATCCTCTCCAGGACCTCAACCTTCCTCGTTCCATGTACAGACATAGAGCCCTTTCCACTTCCTTTTTGTAAGAAATAGTATTCTTTCCCACAGATGTCCAGCTCACACCAGCCTGCTGCTTGCCTTTCACTGACCCCTTCGATGGATGCTACGGACTTGGATCCACTGCCAAGGAAACACGTCACAGAGCAGTGTGTGGTTGGCATACTAAGCTCCACCAAGAAAGAAGACATCACCCAGAGTCATGCTGTATTATCCAGAATACTTATGTGTCTCCATACCAGAGATTGACCACCCAAACTTCTTCATTTATAAAAAGCTTCTCCAAGTACTTGATTGCTTGAAATTGGACTATAGTAGCTTCAAGAAACACTTATAAACATTAGCCAATTACA